Prima di parlare di intolleranze alimentari è utile fare un po’ di chiarezza sulla classificazione delle reazioni avverse agli alimenti. Secondo la classificazione adottata dalla European Academy of Allergology and Clinical Immunology, le reazioni avverse agli alimenti possono essere non tossiche (legate alla sensibilità individuale come allergie e intolleranze) oppure tossiche (non legate ad una particolare suscettibilità individuale come intossicazioni dovute a veleni, batteri, sostanze chimiche tossiche).